Flora
I complessi forestali della Riserva sono ascrivibili prevalentemente all'Associazione Euphorbio apii - quercetum trojanae; ricchi di querce con prevalenza assoluta di Fragno (Quercus trojana). A queste si consociano, quasi sempre in forma secondaria, Quercus pubescens, Quercus virgiliana e piccoli gruppi di Quercus cerris. Quest'ultima, frequentemente, si ibrida con il Fragno.
Nelle zone più soleggiate è il leccio (Quercus ilex) che prevale sul Fragno; in questi ambienti le associazioni arboree spesso degradano verso formazioni di macchia mediterranea o addirittura a garighe. Sono anche presenti comunità vegetali tipicamente steppiche dove, tra l'altro, vive la Stipa austroitalica, pianta tutelata dalla Direttiva 92/43/CEE.
Su alcune pareti calcaree con vegetazione casmofitica vive la rara Campanula versicolor. Uno studio tutt'ora in atto, sulla biodiversità, ha stabilito che le specie vegetali presenti nella Riserva non sono meno di 400 unità di queste circa il 35% sono stenomediterranee, il 28% eurimediterranee, il 16% specie ad ampia distribuzione, il 14% eurasiatiche, il 4 % endemiche, il 2% mediterranee-montane e 1% atlantiche. Prevalgono per il 38% le terofite, seguite dalle emicriptofite per il 31%, geofite per il 19% , fanerofite per il 6%, camefite per il 4%, nanofanerofite per il 2%. Fra le endemiche si ricordano: Carduus micropterus subsp. perspinosus, Centaurea centaurium, Centaurea deusta subsp. deusta, Crepis apula, Crepis corimbosa, Crocus thomasii, Echinops siculus, Iris pseudopumila, Linaria purpurea, Ophrys celiensis, Ophrys oxyrrhincos, Ophrys tarentina, Ornithogalum adalgisae, Stipa austroitalica, Teucrium siculum e Thymus spinulosus.
Inoltre la riserva è ricca di orchidee (fin'ora se ne sono state individuate ben 30 specie) ed ospita pochi esemplari diCrambe hispanica e Jonopsidium albiflorum, iscritte nelle liste rosse entrambe come specie minacciate di estinzione in Puglia.